水辺では，水深や土壌湿度等の環境勾配に沿って，様々な植物がそれぞれの適応的な環境に，連続的に生育しています。このため，ある植物種が水生，湿生，非湿生であるかの区別は文献によって異なってきました（例えば，角野 2014）。
本チェックリストでは水生・湿生植物の定義を提案するとともに，これに基づいて水生・湿生植物を網羅的にリストすることを目的とし作成しました。
すなわち，日本国内に生育する在来の種子植物（一部の外来・園芸植物を含む）8,358分類群を対象として，文献の記述をもとに生育形および生育立地の情報を整理し，これらをもとに沈水・浮遊・浮葉植物，抽水植物（以上を水生植物とした），および湿生植物を区分しました。
